ECSインスタンスの起動時に、特定の環境変数を注入したりスクリプトを実行したりするために利用される機能はどれか。

ユーザーデータ(User Data)を使用することで、OSの初期化時に任意のスクリプト(シェルスクリプトやcloud-config)を実行できます。