モバイル版アプリで「PC版と同じJavaScript」を動作させることは可能か。

PC用のJavaScript APIとモバイル用のAPIは仕様が異なる部分があるが、モバイル用設定欄にファイルをアップロードすることでモバイル版でもスクリプトを動作させることは可能である（ただしモバイル非対応のイベントやAPIもあるためコード修正が必要な場合が多い）。