ストレージコントローラのCPU使用率が低いにもかかわらず、LUNのレイテンシが高い場合、ボトルネックとして疑うべき要素はどれか。

CPUに余裕があるなら、処理能力ではなくバックエンドの物理ディスクの回転数やIOPS限界、あるいはRAIDパリティ計算待ちがボトルネックの可能性が高い。